福建省港航勘察设计院前身为始建于1955年的福建省航管局测量中队和工程技术科。经过50多年艰苦创业和持续发展，我院从过去单一的航道工程勘测设计室发展为具有水运和公路工程规划、勘测、设计、科研、咨询和监理等综合能力的设计院。福建省水运工程重点实验室和福建省港航数学模型仿真技术研究中心也设在我院。目前我院持有国家建设部颁发的水运工程（航道、港口）甲级、工程测量甲级、港口河海（航道）工程咨询甲级、水运工程全行业乙级以及福建省建设厅颁发的公路丙级和水运工程监理丙级资质证书。下属的勘测中心（原勘测大队）还持有国家测绘局颁发的海洋测绘甲级资质证书。

    近十年来，我院勘测设计及科研硕果累累，累计完成各类大中型工程勘测设计及科研课题达300多项。我院独立承担了福建省沿海各港湾如厦门湾10万吨级、湄州湾10～25万吨级、闽江口3万吨级、罗源湾5～30万吨级、三都澳5万吨级、沙埕湾5万吨级等二十多项大型和特大型的航道勘测设计项目，完成了石狮市梅林5000吨级、福建顺利建材2万吨、莆田市中原港务有限公司5万吨级化工专用码头（工可）等20多项大中型码头设计项目，投入使用后，已产生巨大的经济和社会效益。我院还完成了国家一级群众渔港——连江黄岐渔港防波堤工程（软基处理及新型防浪墙结构）设计和湄洲湾锚地十万吨级系船浮简勘测设计、厦门湾港口总体布局规划的前期勘测、《闽江（水口~福州）航道航标工程设计》、厦门马銮湾核心区护岸清淤回填造地（一、二期）工程设计、福安丛贸2万吨级船坞设计等多项重大水运工程勘测设计项目和500多公里县级公路设计项目，以及多项码头施工监理项目任务，其中8项工程勘察设计咨询先后荣获省部级优秀奖。

    我院始终坚持“科技是第一生产力”，不断提高科技创新能力。先后承担了10多项省部级联合科技攻关及省级重点科研课题研究，其中1项获全国优秀工程设计软件铜质奖；获福建省科技进步二等奖2项、三等奖3项；获省厅科技进步一等奖项目3项、二等奖3项。由我院为主研究开发的《航道工程设计CAD系统》，经国内专家评审，该课题研究整体水平达国内领先，为国内第一个较完整的航道工程设计CAD软件。我院航道数模研究成果在实际工程中得到良好应用。我院的精神文明建设及各项工作有近60人次受到省、市、厅、局级表彰，院荣获福建省直机关第七届、第九届文明单位称号。

     我院专业配备齐全，技术力量雄厚，拥有现代化设计、勘测的仪器设备和手段。现有职工118人，高中级职称近60人，教授级高工5人，享受国务院政府津贴的专家3人、获交通部“科技英才”称号1人。拥有先进的“GEDSWATA”多波束扫测系统，DGPS和RTK高精度卫星定位系统10台套及水下摄影系统等仪器设备。我院还保存和积累了福建省闽江及各大型港湾自1886年以来历史长系列的宝贵技术资料。水上勘测采用GPS定位和计算机自动采集数据并成图，实现内外业一体化，工程设计CAD出图率达100%。

    我院始终坚持“突破、创新、赶超、创一流设计精品”的奋斗目标和 “质量第一、诚信为本、客户至上、真诚合作”的服务宗旨。